| 17. Jornada | 03.03.2024 | AC Sparta Praha B | - | 1. SK Prostějov | 4:0 | ||||
| 18. Jornada | 09.03.2024 | 1. SK Prostějov | - | Sigma Olomouc B | 2:0 |  |
|||
| 19. Jornada | 15.03.2024 | FC Sellier & Bellot Vlašim | - | 1. SK Prostějov | 2:1 | ||||
| 20. Jornada | 30.03.2024 | 1. SK Prostějov | - | MFK Chrudim | 2:4 | ||||
| 21. Jornada | 06.04.2024 | Zbrojovka Brno | - | 1. SK Prostějov | 1:2 | |
|||
| 22. Jornada | 13.04.2024 | 1. SK Prostějov | - | FK MAS Táborsko | 2:1 | ||||
| 23. Jornada | 17.04.2024 | 1. SK Prostějov | - | MFK Vyškov | 0:1 | |
|||
| 24. Jornada | 21.04.2024 | FK Varnsdorf | - | 1. SK Prostějov | 5:1 |  |
|||
| 26. Jornada | 04.05.2024 | SK Líšeň | - | 1. SK Prostějov | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 08.05.2024 | 1. SK Prostějov | - | FK Příbram | 2:1 | ||||
| 28. Jornada | 12.05.2024 | FK Dukla Praha | - | 1. SK Prostějov | 3:2 | ||||
| 29. Jornada | 19.05.2024 | 1. SK Prostějov | - | SFC Opava | 3:1 | |
|||
| 30. Jornada | 25.05.2024 | Viktoria Žižkov | - | 1. SK Prostějov | 0:2 | |
República Checa