| 17. Jornada | 19.02.2017 | MFK Karviná | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 |  |
|||
| 18. Jornada | 27.02.2017 | FK Mladá Boleslav | - | FK Teplice | 1:1 |  |
|||
| 21. Jornada | 18.03.2017 | 1. FC Slovácko | - | FK Mladá Boleslav | 2:1 | ||||
| 22. Jornada | 31.03.2017 | FK Mladá Boleslav | - | FK Jablonec | 0:0 | ||||
| 24. Jornada | 15.04.2017 | FK Mladá Boleslav | - | Bohemians Praha 1905 | 1:1 | ||||
| 25. Jornada | 22.04.2017 | Zbrojovka Brno | - | FK Mladá Boleslav | 2:3 | ||||
| 29. Jornada | 20.05.2017 | FK Mladá Boleslav | - | Slavia Praga | 1:2 | ||||
| 30. Jornada | 27.05.2017 | Slovan Liberec | - | FK Mladá Boleslav | 4:0 |
República Checa