| 21. Jornada | 08.02.2009 | Panathinaikos | - | PAOK Saloniki | 3:0 |  |
|||
| 22. Jornada | 15.02.2009 | Iraklis Saloniki | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 21.02.2009 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 24. Jornada | 01.03.2009 | Olympiacos | - | Panathinaikos | 0:0 | |
|||
| 25. Jornada | 07.03.2009 | Panathinaikos | - | AE Lárissa | 3:0 | ||||
| 27. Jornada | 22.03.2009 | Asteras Tripolis | - | Panathinaikos | 1:1 | |
|||
| 28. Jornada | 05.04.2009 | Panathinaikos | - | Skoda Xanthi | 2:0 | ||||
| 29. Jornada | 12.04.2009 | Panserraikos | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 30. Jornada | 26.04.2009 | Panathinaikos | - | OFI Heraklion | 3:1 |
Polonia