| 4. Jornada | 11.08.2018 | VfB Oldenburg | - | FC St. Pauli II | 2:0 |  |
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| 6. Jornada | 26.08.2018 | U.S.I. Lupo-Martini | - | FC St. Pauli II | 0:1 |  |
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| 8. Jornada | 02.09.2018 | FC St. Pauli II | - | Hannover II | 1:0 | |
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| 12. Jornada | 29.09.2018 | FC St. Pauli II | - | VfL Oldenburg | 2:0 | |
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| 15. Jornada | 21.10.2018 | Eintracht Norderstedt | - | FC St. Pauli II | 1:4 | |
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| 16. Jornada | 26.10.2018 | FC St. Pauli II | - | Hamburgo II | 1:0 | ||||
| 17. Jornada | 04.11.2018 | TSV Havelse | - | FC St. Pauli II | 2:1 | |
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| 18. Jornada | 11.11.2018 | Lüneburger SK Hansa | - | FC St. Pauli II | 3:0 | ||||
| 19. Jornada | 18.11.2018 | FC St. Pauli II | - | SV Drochtersen/Assel | 0:1 | |
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| 20. Jornada | 24.11.2018 | Weiche Flensburg 08 | - | FC St. Pauli II | 3:3 | |
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| 32. Jornada | 05.05.2019 | FC St. Pauli II | - | Eintracht Norderstedt | 2:3 | |
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