| 1. Jornada | 02.08.2008 | Sparta Praga | - | FK Mladá Boleslav | 1:0 |  |
|||
| 2. Jornada | 10.08.2008 | FK Mladá Boleslav | - | Tescoma Zlín | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 17.08.2008 | FK Baumit Jablonec | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 | ||||
| 4. Jornada | 25.08.2008 | 1. FC Brno | - | FK Mladá Boleslav | 0:2 |  |
|
||
| 5. Jornada | 31.08.2008 | FK Mladá Boleslav | - | Sigma Olomouc | 2:1 | ||||
| 6. Jornada | 14.09.2008 | Dynamo České Budějovice | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 | |
|||
| 7. Jornada | 21.09.2008 | FK Mladá Boleslav | - | SK Kladno | 2:1 | ||||
| 8. Jornada | 28.09.2008 | Viktoria Žižkov | - | FK Mladá Boleslav | 1:2 | ||||
| 9. Jornada | 05.10.2008 | FK Mladá Boleslav | - | 1. FK Příbram | 3:1 | ||||
| 10. Jornada | 19.10.2008 | FK Teplice | - | FK Mladá Boleslav | 2:3 | ||||
| 11. Jornada | 27.10.2008 | FK Mladá Boleslav | - | Slavia Praga | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 02.11.2008 | Slovan Liberec | - | FK Mladá Boleslav | 3:3 | ||||
| 13. Jornada | 10.11.2008 | FK Mladá Boleslav | - | Baník Ostrava | 0:2 | ||||
| 14. Jornada | 15.11.2008 | Viktoria Plzeň | - | FK Mladá Boleslav | 2:0 | ||||
| 15. Jornada | 23.11.2008 | FK Mladá Boleslav | - | Bohemians Praha | 1:0 | |
República Checa