| 7. Jornada | 02.09.2012 | Lokomotiv Moskva | - | Spartak Moskva | 2:1 | ||||
| 8. Jornada | 15.09.2012 | Lokomotiv Moskva | - | Rubin Kazan | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 22.09.2012 | Terek Grozny | - | Lokomotiv Moskva | 0:3 |  |
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| 10. Jornada | 29.09.2012 | Zenit | - | Lokomotiv Moskva | 1:1 | |
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| 11. Jornada | 06.10.2012 | Lokomotiv Moskva | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 0:1 | ||||
| 14. Jornada | 04.11.2012 | CSKA Moscú | - | Lokomotiv Moskva | 2:1 | ||||
| 15. Jornada | 11.11.2012 | Lokomotiv Moskva | - | Anzhi Makhachkala | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 19.11.2012 | Krylia Sovetov | - | Lokomotiv Moskva | 0:1 | ||||
| 17. Jornada | 24.11.2012 | Lokomotiv Moskva | - | FK Krasnodar | 3:2 | |
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| 18. Jornada | 01.12.2012 | Spartak Vladikavkaz | - | Lokomotiv Moskva | 0:1 | |
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| 21. Jornada | 16.03.2013 | Spartak Moskva | - | Lokomotiv Moskva | 0:0 | |
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| 22. Jornada | 30.03.2013 | Rubin Kazan | - | Lokomotiv Moskva | 2:0 | ||||
| 23. Jornada | 06.04.2013 | Lokomotiv Moskva | - | Terek Grozny | 1:1 | ||||
| 24. Jornada | 13.04.2013 | Lokomotiv Moskva | - | Zenit | 0:1 | |
|||
| 29. Jornada | 20.05.2013 | Anzhi Makhachkala | - | Lokomotiv Moskva | 2:1 | ||||
| 30. Jornada | 26.05.2013 | Lokomotiv Moskva | - | Mordovia Saransk | 2:1 |
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