| 18. Jornada | 13.02.2000 | Fortuna Köln | - | Energie Cottbus | 2:0 | ||||
| 20. Jornada | 26.02.2000 | Mainz | - | Energie Cottbus | 1:0 |  |
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| 21. Jornada | 03.03.2000 | Energie Cottbus | - | SpVgg Greuther Fürth | 4:2 | |
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| 22. Jornada | 10.03.2000 | 1. FC Nürnberg | - | Energie Cottbus | 1:1 | ||||
| 23. Jornada | 19.03.2000 | Energie Cottbus | - | Stuttgarter Kickers | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 27.03.2000 | Chemnitzer FC | - | Energie Cottbus | 1:2 |  |
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| 25. Jornada | 03.04.2000 | Energie Cottbus | - | VfL Bochum | 1:1 | ||||
| 26. Jornada | 07.04.2000 | Hannover | - | Energie Cottbus | 3:2 | |
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| 29. Jornada | 01.05.2000 | Energie Cottbus | - | Bor. Mönchengladbach | 2:2 | |
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| 30. Jornada | 05.05.2000 | Alemannia Aachen | - | Energie Cottbus | 1:0 | |
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| 32. Jornada | 18.05.2000 | Energie Cottbus | - | FC St. Pauli | 3:2 | |
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