| 20. Jornada | 08.01.2017 | Córdoba B | - | San Fernando CD | 0:1 |  |
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| 22. Jornada | 22.01.2017 | CD El Ejido 2012 | - | San Fernando CD | 4:0 | ||||
| 23. Jornada | 29.01.2017 | San Fernando CD | - | La Roda CF | 0:1 | ||||
| 24. Jornada | 05.02.2017 | Mérida AD | - | San Fernando CD | 3:0 | |
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| 25. Jornada | 12.02.2017 | San Fernando CD | - | Lorca FC | 0:1 | ||||
| 26. Jornada | 19.02.2017 | UD Melilla | - | San Fernando CD | 1:0 | ||||
| 36. Jornada | 30.04.2017 | San Fernando CD | - | RB Linense | 0:1 |
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