| 21. Jornada | 17.01.2016 | Getafe B | - | CD Guadalajara | 1:2 | ||||
| 22. Jornada | 24.01.2016 | CD Guadalajara | - | CF Fuenlabrada | 1:3 |  |
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| 24. Jornada | 07.02.2016 | Barakaldo CF | - | CD Guadalajara | 3:2 | ||||
| 25. Jornada | 14.02.2016 | CD Guadalajara | - | SD Gernika | 2:2 | ||||
| 26. Jornada | 21.02.2016 | Club Portugalete | - | CD Guadalajara | 0:2 |  |
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| 27. Jornada | 28.02.2016 | CD Guadalajara | - | SD Leioa | 1:1 | ||||
| 28. Jornada | 06.03.2016 | CF Talavera | - | CD Guadalajara | 5:0 | ||||
| 29. Jornada | 13.03.2016 | CD Guadalajara | - | La Roda CF | 1:1 | |
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| 30. Jornada | 20.03.2016 | CD Ebro | - | CD Guadalajara | 2:0 | |
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| 31. Jornada | 24.03.2016 | CD Guadalajara | - | Rayo Majadahonda | 4:0 | ||||
| 32. Jornada | 03.04.2016 | Real Madrid Castilla | - | CD Guadalajara | 6:3 | |
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| 33. Jornada | 10.04.2016 | CD Guadalajara | - | Real Sociedad B | 2:2 | ||||
| 34. Jornada | 17.04.2016 | Real Unión | - | CD Guadalajara | 3:0 | ||||
| 35. Jornada | 24.04.2016 | CD Guadalajara | - | SD Amorebieta | 2:0 | ||||
| 36. Jornada | 01.05.2016 | Sestao River | - | CD Guadalajara | 1:0 | ||||
| 37. Jornada | 07.05.2016 | CD Guadalajara | - | Arenas de Getxo | 0:1 |
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