| 1. Jornada | 22.01.2006 | Atlante | - | Dorados de Sinaloa | 0:0 |  |
|||
| 2. Jornada | 29.01.2006 | Santos Laguna | - | Atlante | 3:4 | ||||
| 4. Jornada | 05.02.2006 | Club Necaxa | - | Atlante | 1:2 | ||||
| 5. Jornada | 11.02.2006 | Atlante | - | Club San Luis | 1:1 | |
|||
| 6. Jornada | 18.02.2006 | Veracruz (old) | - | Atlante | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 23.02.2006 | Atlante | - | Deportivo Guadalajara | 2:0 | ||||
| 7. Jornada | 26.02.2006 | Atlante | - | Cruz Azul | 1:2 |  |
|||
| 9. Jornada | 12.03.2006 | Atlante | - | CF Pachuca | 1:2 | ||||
| 10. Jornada | 16.03.2006 | Monarcas Morelia | - | Atlante | 0:2 | ||||
| 11. Jornada | 19.03.2006 | Atlante | - | Atlas Guadalajara | 0:1 | ||||
| 12. Jornada | 26.03.2006 | UAG Tecos | - | Atlante | 0:2 | ||||
| 13. Jornada | 02.04.2006 | Atlante | - | Deportivo Toluca | 0:0 | ||||
| 14. Jornada | 08.04.2006 | Jaguares Chiapas | - | Atlante | 1:0 | ||||
| 15. Jornada | 16.04.2006 | Atlante | - | Pumas UNAM | 1:0 | ||||
| 16. Jornada | 23.04.2006 | Atlante | - | CF América | 1:0 | ||||
| 17. Jornada | 01.05.2006 | UANL Tigres | - | Atlante | 0:2 |
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