| 1. Jornada | 06.08.2016 | Gil Vicente | - | Varzim SC | 1:0 | ||||
| 2. Jornada | 13.08.2016 | Varzim SC | - | Benfica B | 2:0 | ||||
| 3. Jornada | 20.08.2016 | Académico de Viseu | - | Varzim SC | 2:2 |  |
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| 5. Jornada | 28.08.2016 | Leixões SC | - | Varzim SC | 3:0 | |
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| 4. Jornada | 04.09.2016 | Varzim SC | - | CD Aves | 0:2 | |
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| 6. Jornada | 11.09.2016 | Varzim SC | - | Sporting CP B | 3:0 | ||||
| 7. Jornada | 17.09.2016 | Sporting Braga B | - | Varzim SC | 1:1 | ||||
| 8. Jornada | 21.09.2016 | Varzim SC | - | SC Olhanense | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 28.09.2016 | CD Santa Clara | - | Varzim SC | 2:1 | ||||
| 10. Jornada | 02.10.2016 | Varzim SC | - | SC Freamunde | 0:0 | |
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| 11. Jornada | 10.10.2016 | Académica de Coimbra | - | Varzim SC | 3:2 |  |
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| 13. Jornada | 30.10.2016 | FC Penafiel | - | Varzim SC | 2:1 | ||||
| 17. Jornada | 04.12.2016 | Sporting Covilhã | - | Varzim SC | 2:0 | |
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| 23. Jornada | 23.01.2017 | Benfica B | - | Varzim SC | 1:2 | ||||
| 24. Jornada | 28.01.2017 | Varzim SC | - | Académico de Viseu | 1:1 | ||||
| 25. Jornada | 05.02.2017 | CD Aves | - | Varzim SC | 1:2 | |
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| 26. Jornada | 11.02.2017 | Varzim SC | - | Leixões SC | 1:0 | ||||
| 27. Jornada | 15.02.2017 | Sporting CP B | - | Varzim SC | 1:2 | ||||
| 28. Jornada | 19.02.2017 | Varzim SC | - | Sporting Braga B | 0:1 |
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