| Grupo 1 | 13.04.2006 | Caracas FC | - | Deportivo Guadalajara | 0:0 | ||||
| Grupo 1 | 21.04.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Cienciano | 0:0 | ||||
| Octavos de final | 03.05.2006 | Santa Fe | - | Deportivo Guadalajara | 3:1 | ||||
| Cuartos de final | 10.05.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Vélez Sarsfield | 0:0 | ||||
| Cuartos de final | 21.07.2006 | Vélez Sarsfield | - | Deportivo Guadalajara | 1:2 | ||||
| Semifinales | 27.07.2006 | Deportivo Guadalajara | - | São Paulo FC | 0:1 | ||||
| Semifinales | 03.08.2006 | São Paulo FC | - | Deportivo Guadalajara | 3:0 |  |
México