| Primera etapa | 15.09.1998 | Atlético | - | FK Obilić | 2:0 |  |
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| Primera etapa | 29.09.1998 | FK Obilić | - | Atlético | 0:1 | ||||
| Segunda etapa | 03.11.1998 | Atlético | - | CSKA Sofia | 1:0 | ||||
| Octavos de final | 08.12.1998 | Atlético | - | Real Sociedad | 4:1 pró. | |
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| Cuartos de final | 02.03.1999 | Atlético | - | Roma | 2:1 | |
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| Cuartos de final | 16.03.1999 | Roma | - | Atlético | 1:2 | ||||
| Semifinales | 06.04.1999 | Atlético | - | Parma AC | 1:3 |
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