| 2. Jornada | 31.08.2012 | Panathinaikos | - | PAS Giannina | 1:1 |  |
|||
| 4. Jornada | 24.09.2012 | Panathinaikos | - | Atromitos | 1:1 | ||||
| 7. Jornada | 21.10.2012 | Panathinaikos | - | Aris Saloniki | 1:1 | ||||
| 8. Jornada | 29.10.2012 | OFI Heraklion | - | Panathinaikos | 2:2 | ||||
| 11. Jornada | 18.11.2012 | Panathinaikos | - | PAOK Saloniki | 2:0 | ||||
| 12. Jornada | 25.11.2012 | Platanias Chanion | - | Panathinaikos | 2:1 | ||||
| 15. Jornada | 16.12.2012 | Veria FC | - | Panathinaikos | 3:0 | ||||
| 17. Jornada | 13.01.2013 | PAS Giannina | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 20. Jornada | 02.02.2013 | Asteras Tripolis | - | Panathinaikos | 2:2 |  |
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