| 1. Jornada | 06.08.2006 | Atlante | - | Monarcas Morelia | 2:0 | ||||
| 2. Jornada | 13.08.2006 | Cruz Azul | - | Atlante | 2:1 |  |
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| 3. Jornada | 20.08.2006 | Atlante | - | Club San Luis | 1:0 | |
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| 5. Jornada | 30.08.2006 | Atlante | - | UANL Tigres | 2:0 | |
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| 6. Jornada | 03.09.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Atlante | 1:1 | ||||
| 7. Jornada | 10.09.2006 | Atlante | - | Atlas Guadalajara | 0:2 | |
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| 10. Jornada | 24.09.2006 | Gallos Blancos (old) | - | Atlante | 1:2 | ||||
| 11. Jornada | 01.10.2006 | Atlante | - | Jaguares Chiapas | 0:1 | ||||
| 12. Jornada | 08.10.2006 | Pumas UNAM | - | Atlante | 0:1 | ||||
| 13. Jornada | 15.10.2006 | Atlante | - | Deportivo Toluca | 2:2 | |
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| 14. Jornada | 21.10.2006 | UAG Tecos | - | Atlante | 3:1 | |
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| 16. Jornada | 05.11.2006 | Atlante | - | CF América | 0:0 | ||||
| 17. Jornada | 12.11.2006 | CF Pachuca | - | Atlante | 2:2 |
Argentina