| 1. Jornada | 02.07.2016 | Alianza Petrolera | - | Atlético Nacional | 3:3 | ||||
| 2. Jornada | 11.07.2016 | Atlético Nacional | - | Jaguares de Córdoba | 2:1 | ||||
| 4. Jornada | 17.07.2016 | Atlético Nacional | - | Deportes Tolima | 2:2 | ||||
| 5. Jornada | 24.07.2016 | Fortaleza FC | - | Atlético Nacional | 0:1 | ||||
| 6. Jornada | 01.08.2016 | Deportivo Cali | - | Atlético Nacional | 1:0 |  |
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| 7. Jornada | 08.08.2016 | Atlético Nacional | - | Once Caldas | 1:0 | ||||
| 8. Jornada | 15.08.2016 | Boyacá Chicó | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| 11. Jornada | 10.09.2016 | Atlético Bucaramanga | - | Atlético Nacional | 2:2 | ||||
| 13. Jornada | 18.09.2016 | Envigado FC | - | Atlético Nacional | 0:0 | |
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| 14. Jornada | 25.09.2016 | Atlético Nacional | - | Cortuluá | 1:1 | ||||
| 3. Jornada | 09.10.2016 | Águilas Doradas | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 16.10.2016 | Atlético Nacional | - | Atlético Huila | 4:0 | ||||
| 17. Jornada | 23.10.2016 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 2:2 |  |
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| 19. Jornada | 07.11.2016 | Santa Fe | - | Atlético Nacional | 0:0 |  |
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| 12. Jornada | 10.11.2016 | Atlético Nacional | - | Atlético Junior | 2:2 | |
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