| 20. Jornada | 08.01.2016 | FC Bourg-Péronnas | - | US Créteil-Lusitanos | 5:1 |  |
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| 21. Jornada | 15.01.2016 | Dijon FCO | - | FC Bourg-Péronnas | 3:0 | ||||
| 22. Jornada | 22.01.2016 | FC Bourg-Péronnas | - | Valenciennes FC | 0:0 | ||||
| 24. Jornada | 02.02.2016 | FC Bourg-Péronnas | - | Tours FC | 0:2 | ||||
| 25. Jornada | 05.02.2016 | Stade Brestois 29 | - | FC Bourg-Péronnas | 2:1 | ||||
| 26. Jornada | 12.02.2016 | FC Bourg-Péronnas | - | Stade Lavallois | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 19.02.2016 | Évian Thonon Gaillard | - | FC Bourg-Péronnas | 1:1 | ||||
| 28. Jornada | 26.02.2016 | FC Bourg-Péronnas | - | Clermont Foot 63 | 1:2 | |
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| 30. Jornada | 11.03.2016 | FC Bourg-Péronnas | - | AS Nancy Lorraine | 2:0 | |
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| 31. Jornada | 18.03.2016 | AJ Auxerre | - | FC Bourg-Péronnas | 1:2 | ||||
| 32. Jornada | 01.04.2016 | FC Bourg-Péronnas | - | AC Ajaccio | 3:0 | ||||
| 33. Jornada | 08.04.2016 | Paris FC | - | FC Bourg-Péronnas | 2:0 | ||||
| 34. Jornada | 15.04.2016 | FC Bourg-Péronnas | - | FC Metz | 0:3 |  |
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| 36. Jornada | 29.04.2016 | Red Star FC | - | FC Bourg-Péronnas | 1:0 | ||||
| 37. Jornada | 06.05.2016 | FC Bourg-Péronnas | - | RC Lens | 2:1 | ||||
| 38. Jornada | 13.05.2016 | Havre AC | - | FC Bourg-Péronnas | 5:0 |
Reunión