| 21. Jornada | 14.01.2017 | Mallorca B | - | Atlético Baleares | 0:0 |  |
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| 24. Jornada | 05.02.2017 | Atlético Baleares | - | Barcelona B | 2:1 | ||||
| 25. Jornada | 12.02.2017 | CE Sabadell | - | Atlético Baleares | 1:0 | ||||
| 28. Jornada | 05.03.2017 | Atlético Baleares | - | CD Eldense | 5:0 | ||||
| 31. Jornada | 26.03.2017 | CE L'Hospitalet | - | Atlético Baleares | 0:4 |  |
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| 32. Jornada | 02.04.2017 | Atlético Baleares | - | AE Prat | 1:0 | |
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| 33. Jornada | 09.04.2017 | Espanyol B | - | Atlético Baleares | 1:3 | |
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| 34. Jornada | 16.04.2017 | Atlético Baleares | - | CD Ebro | 1:1 | ||||
| 35. Jornada | 23.04.2017 | Atlético Saguntino | - | Atlético Baleares | 0:0 | ||||
| 36. Jornada | 30.04.2017 | Atlético Baleares | - | Hércules CF | 0:1 | ||||
| 37. Jornada | 07.05.2017 | Villarreal B | - | Atlético Baleares | 1:2 | |
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| 38. Jornada | 14.05.2017 | Atlético Baleares | - | CD Alcoyano | 1:0 |
España