| 18. Jornada | 29.01.2023 | 1. FC Nürnberg | - | FC St. Pauli | 0:1 | ||||
| 19. Jornada | 05.02.2023 | FC St. Pauli | - | Hannover | 2:0 |  |
|||
| 20. Jornada | 12.02.2023 | FC St. Pauli | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 18.02.2023 | 1. FC Magdeburg | - | FC St. Pauli | 1:2 | ||||
| 22. Jornada | 26.02.2023 | FC St. Pauli | - | Hansa Rostock | 1:0 | |
|||
| 23. Jornada | 03.03.2023 | SC Paderborn 07 | - | FC St. Pauli | 1:2 | ||||
| 24. Jornada | 11.03.2023 | FC St. Pauli | - | SpVgg Greuther Fürth | 2:1 | ||||
| 25. Jornada | 19.03.2023 | SV Sandhausen | - | FC St. Pauli | 0:5 | ||||
| 26. Jornada | 01.04.2023 | FC St. Pauli | - | Jahn Regensburg | 1:0 | ||||
| 27. Jornada | 08.04.2023 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | FC St. Pauli | 0:1 | ||||
| 28. Jornada | 16.04.2023 | FC St. Pauli | - | Eintracht Braunschweig | 1:2 | ||||
| 29. Jornada | 21.04.2023 | Hamburgo | - | FC St. Pauli | 4:3 | ||||
| 30. Jornada | 29.04.2023 | FC St. Pauli | - | Arminia Bielefeld | 2:1 | ||||
| 31. Jornada | 06.05.2023 | Darmstadt | - | FC St. Pauli | 0:3 | ||||
| 32. Jornada | 13.05.2023 | FC St. Pauli | - | Fortuna Düsseldorf | 0:0 | |
|||
| 33. Jornada | 19.05.2023 | Holstein Kiel | - | FC St. Pauli | 3:4 | ||||
| 34. Jornada | 28.05.2023 | FC St. Pauli | - | Karlsruher SC | 1:1 | |
Estonia