| 12. Jornada | 19.05.2007 | RB Omiya Ardija | - | Yokohama FC | 1:0 | ||||
| 13. Jornada | 26.05.2007 | Yokohama FC | - | Oita Trinita | 2:1 | ||||
| 14. Jornada | 09.06.2007 | Gamba Osaka | - | Yokohama FC | 2:1 |  |
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| 15. Jornada | 16.06.2007 | Yokohama FC | - | Júbilo Iwata | 1:2 | |
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| 16. Jornada | 20.06.2007 | Albirex Niigata | - | Yokohama FC | 3:1 | ||||
| 17. Jornada | 23.06.2007 | Yokohama FC | - | Kashiwa Reysol | 2:4 | ||||
| 18. Jornada | 30.06.2007 | Yokohama FC | - | JEF United Chiba | 0:1 | |
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| 19. Jornada | 11.08.2007 | Yokohama F. Marinos | - | Yokohama FC | 8:1 | |
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| 20. Jornada | 15.08.2007 | Yokohama FC | - | Ventforet Kofu | 0:2 | ||||
| 21. Jornada | 18.08.2007 | Yokohama FC | - | Gamba Osaka | 1:1 | ||||
| 22. Jornada | 25.08.2007 | Kashima Antlers | - | Yokohama FC | 2:1 | ||||
| 28. Jornada | 07.10.2007 | Yokohama FC | - | Kawasaki Frontale | 0:1 | |
|||
| 29. Jornada | 20.10.2007 | Vissel Kobe | - | Yokohama FC | 3:0 | ||||
| 30. Jornada | 27.10.2007 | Yokohama FC | - | RB Omiya Ardija | 0:1 |
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