| 2. Jornada | 23.07.2016 | SV Seligenporten | - | Bayern Múnich II | 1:2 | ||||
| 11. Jornada | 16.09.2016 | Bayern Múnich II | - | FC Memmingen | 2:1 | ||||
| 15. Jornada | 15.10.2016 | SV Schalding-Heining | - | Bayern Múnich II | 2:2 | ||||
| 18. Jornada | 05.11.2016 | FV Illertissen | - | Bayern Múnich II | 0:1 | ||||
| 20. Jornada | 18.11.2016 | Bayern Múnich II | - | TSV Buchbach | 4:0 | ||||
| 21. Jornada | 27.11.2016 | SpVgg Unterhaching | - | Bayern Múnich II | 2:1 |  |
|||
| 22. Jornada | 03.03.2017 | Bayern Múnich II | - | Ingolstadt II | 0:1 | ||||
| 23. Jornada | 09.03.2017 | Bayern Múnich II | - | SpVgg Bayreuth | 1:1 | ||||
| 25. Jornada | 12.03.2017 | Bayern Múnich II | - | TSV 1860 München II | 0:2 | |
|||
| 24. Jornada | 19.03.2017 | TSV 1860 Rosenheim | - | Bayern Múnich II | 2:1 | ||||
| 28. Jornada | 13.04.2017 | Bayern Múnich II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:2 | ||||
| 29. Jornada | 17.04.2017 | Bayern Múnich II | - | SpVgg Bayern Hof | 5:0 | ||||
| 31. Jornada | 28.04.2017 | Augsburgo II | - | Bayern Múnich II | 3:3 | ||||
| 33. Jornada | 12.05.2017 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Bayern Múnich II | 1:3 | ||||
| 34. Jornada | 18.05.2017 | Bayern Múnich II | - | 1. FC Nürnberg II | 2:1 |
Alemania