| 6. Jornada | 13.09.1998 | SpVgg Unterhaching | - | Mainz | 1:0 | ||||
| 7. Jornada | 20.09.1998 | Mainz | - | Hannover | 1:0 |  |
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| 8. Jornada | 28.09.1998 | SSV Ulm 1846 | - | Mainz | 4:2 | ||||
| 9. Jornada | 04.10.1998 | FC Gütersloh | - | Mainz | 6:1 | |
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| 10. Jornada | 18.10.1998 | Mainz | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
| 11. Jornada | 23.10.1998 | Energie Cottbus | - | Mainz | 2:2 | ||||
| 12. Jornada | 30.10.1998 | Mainz | - | Rot-Weiß Oberhausen | 0:0 | ||||
| 20. Jornada | 26.02.1999 | Karlsruher SC | - | Mainz | 0:1 | |
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| 21. Jornada | 08.03.1999 | Mainz | - | Arminia Bielefeld | 3:1 | ||||
| 22. Jornada | 14.03.1999 | Colonia | - | Mainz | 2:1 | ||||
| 23. Jornada | 21.03.1999 | Mainz | - | SpVgg Unterhaching | 1:0 | ||||
| 28. Jornada | 02.05.1999 | Mainz | - | Energie Cottbus | 0:0 | ||||
| 29. Jornada | 09.05.1999 | Rot-Weiß Oberhausen | - | Mainz | 2:1 | |
|||
| 30. Jornada | 16.05.1999 | Mainz | - | Fortuna Köln | 1:1 | |
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| 32. Jornada | 28.05.1999 | Mainz | - | KFC Uerdingen 05 | 3:0 | ||||
| 33. Jornada | 13.06.1999 | Stuttgarter Kickers | - | Mainz | 1:3 | ||||
| 34. Jornada | 17.06.1999 | Mainz | - | TeBe Berlin | 0:3 | |
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