| 1. Jornada | 01.08.2003 | Borussia Dortmund II | - | SC Paderborn 07 | 0:1 |  |
|||
| 2. Jornada | 09.08.2003 | Schalke II | - | Borussia Dortmund II | 0:2 | ||||
| 6. Jornada | 07.09.2003 | Borussia Dortmund II | - | Werder Bremen II | 2:1 | ||||
| 16. Jornada | 15.11.2003 | Borussia Dortmund II | - | Rot-Weiss Essen | 0:1 | ||||
| 18. Jornada | 29.11.2003 | SC Paderborn 07 | - | Borussia Dortmund II | 1:3 | ||||
| 21. Jornada | 07.03.2004 | Sachsen Leipzig | - | Borussia Dortmund II | 0:1 | ||||
| 22. Jornada | 14.03.2004 | Borussia Dortmund II | - | Colonia | 0:4 | ||||
| 23. Jornada | 21.03.2004 | Werder Bremen II | - | Borussia Dortmund II | 2:1 | ||||
| 24. Jornada | 27.03.2004 | Borussia Dortmund II | - | VfR Neumünster | 1:2 |  |
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| 20. Jornada | 30.03.2004 | Borussia Dortmund II | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 28. Jornada | 25.04.2004 | Borussia Dortmund II | - | FC St. Pauli | 0:2 | ||||
| 29. Jornada | 02.05.2004 | Dynamo Dresden | - | Borussia Dortmund II | 3:1 | |
|||
| 31. Jornada | 15.05.2004 | Hamburgo II | - | Borussia Dortmund II | 1:1 | ||||
| 30. Jornada | 19.05.2004 | Borussia Dortmund II | - | Wuppertaler SV | 1:2 | ||||
| 32. Jornada | 22.05.2004 | Borussia Dortmund II | - | Holstein Kiel | 2:0 |
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