| 21. Jornada | 08.02.2009 | Skoda Xanthi | - | Levadiakos | 4:0 |  |
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| 22. Jornada | 15.02.2009 | Panserraikos | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 23. Jornada | 21.02.2009 | Skoda Xanthi | - | OFI Heraklion | 0:0 |  |
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| 25. Jornada | 08.03.2009 | Skoda Xanthi | - | Panthrakikos | 1:0 | |
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| 26. Jornada | 14.03.2009 | Aris Saloniki | - | Skoda Xanthi | 0:1 | |
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| 27. Jornada | 22.03.2009 | Skoda Xanthi | - | Ergotelis | 0:1 | ||||
| 28. Jornada | 05.04.2009 | Panathinaikos | - | Skoda Xanthi | 2:0 |
República Checa