| 17. Jornada | 01.03.2009 | FC Wohlen | - | FC Wil 1900 | 0:1 |  |
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| 18. Jornada | 08.03.2009 | Yverdon Sport FC | - | FC Wohlen | 2:1 | ||||
| 20. Jornada | 22.03.2009 | FC Lugano | - | FC Wohlen | 2:0 | ||||
| 22. Jornada | 09.04.2009 | FC Thun | - | FC Wohlen | 1:2 | ||||
| 23. Jornada | 20.04.2009 | FC Wohlen | - | FC Concordia Basel | 2:1 | |
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| 24. Jornada | 23.04.2009 | FC Biel/Bienne | - | FC Wohlen | 5:1 | |
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| 26. Jornada | 02.05.2009 | Servette FC | - | FC Wohlen | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 09.05.2009 | FC Wohlen | - | FC Schaffhausen | 0:0 | ||||
| 28. Jornada | 16.05.2009 | FC Wohlen | - | FC Gossau | 2:0 | ||||
| 29. Jornada | 23.05.2009 | FC La Chaux-de-Fonds | - | FC Wohlen | 1:1 | ||||
| 30. Jornada | 30.05.2009 | FC Stade Nyonnais | - | FC Wohlen | 1:3 |
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