| Segunda etapa | 26.08.2016 | Cuiabá - MT | - | Chapecoense | 1:0 |  |
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| Segunda etapa | 01.09.2016 | Chapecoense | - | Cuiabá - MT | 3:1 |  |
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| Octavos de final | 22.09.2016 | Independiente | - | Chapecoense | 0:0 | ||||
| Cuartos de final | 27.10.2016 | Chapecoense | - | Atlético Junior | 3:0 | |
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| Semifinales | 03.11.2016 | San Lorenzo | - | Chapecoense | 1:1 | ||||
| Semifinales | 24.11.2016 | Chapecoense | - | San Lorenzo | 0:0 |
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