| 11. Jornada | 18.01.2017 | AO Chania | - | Aiginiakos FC | 3:2 | ||||
| 12. Jornada | 22.01.2017 | Aiginiakos FC | - | GS Kallithea | 1:2 | ||||
| 13. Jornada | 29.01.2017 | Panegialios FC | - | Aiginiakos FC | 1:1 |  |
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| 14. Jornada | 05.02.2017 | Agrotikos Asteras | - | Aiginiakos FC | 1:0 | ||||
| 15. Jornada | 12.02.2017 | Aiginiakos FC | - | Panserraikos | 0:0 | ||||
| 16. Jornada | 19.02.2017 | Acharnaikos FC | - | Aiginiakos FC | 3:1 |  |
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| 19. Jornada | 05.03.2017 | Aiginiakos FC | - | Aris Saloniki | 0:1 | |
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| 21. Jornada | 19.03.2017 | Aiginiakos FC | - | Sparta FC | 1:0 | ||||
| 22. Jornada | 22.03.2017 | Anagennisi Karditsa | - | Aiginiakos FC | 2:1 | |
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| 23. Jornada | 26.03.2017 | Apollon Smyrnis | - | Aiginiakos FC | 4:1 | ||||
| 24. Jornada | 02.04.2017 | Aiginiakos FC | - | Kissamikos | 2:0 | ||||
| 25. Jornada | 09.04.2017 | AEL Kalloni | - | Aiginiakos FC | 1:3 | |
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| 26. Jornada | 13.04.2017 | Aiginiakos FC | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 23.04.2017 | AO Trikala | - | Aiginiakos FC | 5:0 |
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