| 20. Jornada | 03.02.2012 | SC Paderborn 07 | - | 1. FC Union Berlin | 3:2 | ||||
| 21. Jornada | 12.02.2012 | SpVgg Greuther Fürth | - | SC Paderborn 07 | 5:1 | ||||
| 22. Jornada | 17.02.2012 | SC Paderborn 07 | - | Dynamo Dresden | 2:2 | ||||
| 23. Jornada | 26.02.2012 | SC Paderborn 07 | - | Eintracht Frankfurt | 4:2 |  |
|||
| 24. Jornada | 03.03.2012 | Alemannia Aachen | - | SC Paderborn 07 | 0:3 | ||||
| 25. Jornada | 09.03.2012 | SC Paderborn 07 | - | VfL Bochum | 0:0 | ||||
| 26. Jornada | 17.03.2012 | Ingolstadt | - | SC Paderborn 07 | 4:0 | ||||
| 27. Jornada | 25.03.2012 | SC Paderborn 07 | - | MSV Duisburg | 1:2 | ||||
| 28. Jornada | 30.03.2012 | Eintracht Braunschweig | - | SC Paderborn 07 | 0:0 | ||||
| 29. Jornada | 08.04.2012 | SC Paderborn 07 | - | TSV 1860 München | 2:2 | ||||
| 30. Jornada | 11.04.2012 | Erzgebirge Aue | - | SC Paderborn 07 | 0:2 | |
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| 31. Jornada | 15.04.2012 | SC Paderborn 07 | - | Energie Cottbus | 3:1 | ||||
| 32. Jornada | 22.04.2012 | Karlsruher SC | - | SC Paderborn 07 | 2:0 |  |
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| 33. Jornada | 29.04.2012 | SC Paderborn 07 | - | FSV Frankfurt | 1:0 | ||||
| 34. Jornada | 06.05.2012 | FC St. Pauli | - | SC Paderborn 07 | 5:0 |
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