| 7. Jornada | 30.04.2006 | FK Moskva | - | Lokomotiv Moskva | 0:1 | ||||
| 8. Jornada | 06.05.2006 | Lokomotiv Moskva | - | Zenit | 3:1 |  |
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| 9. Jornada | 14.05.2006 | Torpedo Moskva | - | Lokomotiv Moskva | 1:4 | |
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| 28. Jornada | 06.07.2006 | Lokomotiv Moskva | - | FK Saturn | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 11.07.2006 | Lokomotiv Moskva | - | Dinamo Moskva | 2:0 | ||||
| 11. Jornada | 16.07.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | Lokomotiv Moskva | 1:3 | ||||
| 12. Jornada | 22.07.2006 | Lokomotiv Moskva | - | FK Tom Tomsk | 1:1 | ||||
| 13. Jornada | 30.07.2006 | FK Saturn | - | Lokomotiv Moskva | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 06.08.2006 | Lokomotiv Moskva | - | FK Amkar Perm | 0:0 | ||||
| 15. Jornada | 13.08.2006 | FK Rostov | - | Lokomotiv Moskva | 1:2 |  |
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| 17. Jornada | 26.08.2006 | Lokomotiv Moskva | - | Luch-Energiya Vladivostok | 3:0 | ||||
| 18. Jornada | 10.09.2006 | Spartak Nalchik | - | Lokomotiv Moskva | 0:1 | ||||
| 19. Jornada | 17.09.2006 | Lokomotiv Moskva | - | Spartak Moskva | 0:0 | |
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| 20. Jornada | 23.09.2006 | CSKA Moscú | - | Lokomotiv Moskva | 1:2 |
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