| 1. Jornada | 26.08.2012 | OFI Heraklion | - | Skoda Xanthi | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 01.09.2012 | Skoda Xanthi | - | AEK Athen | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 16.09.2012 | AO Kerkyra | - | Skoda Xanthi | 1:1 |  |
|||
| 4. Jornada | 22.09.2012 | Skoda Xanthi | - | PAOK Saloniki | 0:3 | ||||
| 5. Jornada | 30.09.2012 | Platanias Chanion | - | Skoda Xanthi | 3:2 | |
|||
| 6. Jornada | 07.10.2012 | Skoda Xanthi | - | Panathinaikos | 1:2 | |
|||
| 11. Jornada | 18.11.2012 | Skoda Xanthi | - | Panthrakikos | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 24.11.2012 | Atromitos | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 13. Jornada | 01.12.2012 | Skoda Xanthi | - | Asteras Tripolis | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 09.12.2012 | Skoda Xanthi | - | Panionios GSS | 4:0 | |
|||
| 15. Jornada | 16.12.2012 | Aris Saloniki | - | Skoda Xanthi | 0:0 | ||||
| 17. Jornada | 12.01.2013 | AEK Athen | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 20. Jornada | 02.02.2013 | Skoda Xanthi | - | Platanias Chanion | 2:0 | ||||
| 22. Jornada | 17.02.2013 | Skoda Xanthi | - | Olympiacos | 0:2 | ||||
| 23. Jornada | 23.02.2013 | Skoda Xanthi | - | Veria FC | 0:2 | ||||
| 24. Jornada | 03.03.2013 | Levadiakos | - | Skoda Xanthi | 1:4 | ||||
| 25. Jornada | 10.03.2013 | Skoda Xanthi | - | PAS Giannina | 0:1 |
Grecia