| 7. Jornada | 17.09.2016 | Zbrojovka Brno | - | FC Hradec Králové | 1:1 | ||||
| 8. Jornada | 24.09.2016 | FC Hradec Králové | - | FC Fastav Zlín | 0:2 | ||||
| 11. Jornada | 23.10.2016 | Slovan Liberec | - | FC Hradec Králové | 2:0 | ||||
| 12. Jornada | 30.10.2016 | FC Hradec Králové | - | MFK Karviná | 3:4 | ||||
| 13. Jornada | 05.11.2016 | FK Teplice | - | FC Hradec Králové | 0:1 | ||||
| 19. Jornada | 04.03.2017 | FC Hradec Králové | - | FK Mladá Boleslav | 0:0 | ||||
| 20. Jornada | 11.03.2017 | 1. FK Příbram | - | FC Hradec Králové | 1:0 | ||||
| 16. Jornada | 14.03.2017 | FK Jablonec | - | FC Hradec Králové | 2:1 | ||||
| 21. Jornada | 19.03.2017 | FC Hradec Králové | - | Zbrojovka Brno | 0:0 | ||||
| 22. Jornada | 01.04.2017 | FC Fastav Zlín | - | FC Hradec Králové | 1:3 |  |
|||
| 23. Jornada | 07.04.2017 | FC Hradec Králové | - | Viktoria Plzeň | 0:1 | ||||
| 24. Jornada | 17.04.2017 | Slavia Praga | - | FC Hradec Králové | 4:0 | ||||
| 25. Jornada | 22.04.2017 | FC Hradec Králové | - | Slovan Liberec | 0:1 | |
|||
| 26. Jornada | 30.04.2017 | MFK Karviná | - | FC Hradec Králové | 4:2 | ||||
| 27. Jornada | 07.05.2017 | FC Hradec Králové | - | FK Teplice | 0:2 | |
República Checa