| Primera etapa | 15.09.2005 | Middlesbrough | - | Skoda Xanthi | 2:0 |  |
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| Grupo D | 20.10.2005 | Grasshopper Club Zürich | - | Middlesbrough | 0:1 | ||||
| Grupo D | 03.11.2005 | Middlesbrough | - | Dnipro Dnipropetrovsk | 3:0 | |
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| Grupo D | 24.11.2005 | AZ Alkmaar | - | Middlesbrough | 0:0 | ||||
| Octavos de final | 09.03.2006 | Middlesbrough | - | Roma | 1:0 | ||||
| Cuartos de final | 30.03.2006 | Basilea | - | Middlesbrough | 2:0 | ||||
| Cuartos de final | 06.04.2006 | Middlesbrough | - | Basilea | 4:1 | |
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| Semifinales | 27.04.2006 | Middlesbrough | - | FC Steaua Bucureşti | 4:2 | |
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| Final | 10.05.2006 | Middlesbrough | - | Sevilla | 0:4 |
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