| 21. Jornada | 06.03.2004 | Preußen Münster | - | Dynamo Dresden | 2:2 | ||||
| 22. Jornada | 14.03.2004 | Sachsen Leipzig | - | Preußen Münster | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 21.03.2004 | Preußen Münster | - | Wuppertaler SV | 1:1 | ||||
| 24. Jornada | 27.03.2004 | Colonia | - | Preußen Münster | 2:1 | ||||
| 20. Jornada | 30.03.2004 | Borussia Dortmund II | - | Preußen Münster | 1:1 |  |
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| 25. Jornada | 03.04.2004 | Preußen Münster | - | Hamburgo II | 1:0 | ||||
| 26. Jornada | 10.04.2004 | Werder Bremen II | - | Preußen Münster | 4:3 | ||||
| 27. Jornada | 17.04.2004 | Preußen Münster | - | Holstein Kiel | 2:1 | |
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| 28. Jornada | 25.04.2004 | VfR Neumünster | - | Preußen Münster | 0:0 | ||||
| 29. Jornada | 01.05.2004 | Preußen Münster | - | Rot-Weiss Essen | 1:3 | |
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| 30. Jornada | 08.05.2004 | KFC Uerdingen 05 | - | Preußen Münster | 1:2 | ||||
| 31. Jornada | 15.05.2004 | Preußen Münster | - | Chemnitzer FC | 1:0 | ||||
| 32. Jornada | 22.05.2004 | Eintracht Braunschweig | - | Preußen Münster | 1:3 | |
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| 33. Jornada | 30.05.2004 | SC Paderborn 07 | - | Preußen Münster | 2:2 | ||||
| 34. Jornada | 05.06.2004 | Preußen Münster | - | SG Wattenscheid 09 | 1:0 | |
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