| 1. Jornada | 31.07.2016 | Mushuc Runa | - | LDU Quito | 3:0 | ||||
| 3. Jornada | 13.08.2016 | Mushuc Runa | - | Deportivo Cuenca | 3:2 | ||||
| 4. Jornada | 21.08.2016 | Aucas | - | Mushuc Runa | 0:1 | ||||
| 5. Jornada | 27.08.2016 | Mushuc Runa | - | El Nacional | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 04.09.2016 | Mushuc Runa | - | Delfín SC | 1:0 | ||||
| 7. Jornada | 10.09.2016 | Club Deportivo River Plate Ecuador | - | Mushuc Runa | 0:0 | ||||
| 8. Jornada | 18.09.2016 | Mushuc Runa | - | Emelec | 3:0 | ||||
| 9. Jornada | 21.09.2016 | Fuerza Amarilla | - | Mushuc Runa | 1:2 |  |
|||
| 10. Jornada | 25.09.2016 | Mushuc Runa | - | Universidad Catolica | 1:1 | ||||
| 11. Jornada | 01.10.2016 | Independiente del Valle | - | Mushuc Runa | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 19.10.2016 | Mushuc Runa | - | Fuerza Amarilla | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 30.10.2016 | Mushuc Runa | - | Club Deportivo River Plate Ecuador | 0:2 | ||||
| 18. Jornada | 12.11.2016 | El Nacional | - | Mushuc Runa | 2:1 | ||||
| 20. Jornada | 27.11.2016 | Deportivo Cuenca | - | Mushuc Runa | 3:1 | ||||
| 21. Jornada | 04.12.2016 | Mushuc Runa | - | Barcelona | 2:4 | |
Ecuador