| 2. Jornada | 31.08.2013 | Cádiz CF | - | CD Guadalajara | 1:0 |  |
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| 3. Jornada | 08.09.2013 | CD Guadalajara | - | Córdoba B | 3:0 | |
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| 4. Jornada | 15.09.2013 | Algeciras CF | - | CD Guadalajara | 1:1 | |
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| 5. Jornada | 21.09.2013 | CD Guadalajara | - | RB Linense | 1:2 | ||||
| 6. Jornada | 29.09.2013 | Écija Balompié | - | CD Guadalajara | 1:2 | ||||
| 7. Jornada | 06.10.2013 | CD Guadalajara | - | Atlético Sanluqueño CF | 2:1 |  |
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| 8. Jornada | 13.10.2013 | El Palo FC | - | CD Guadalajara | 1:2 | ||||
| 9. Jornada | 19.10.2013 | CD Guadalajara | - | Granada B | 1:0 | ||||
| 10. Jornada | 27.10.2013 | Lucena CF | - | CD Guadalajara | 1:0 | ||||
| 11. Jornada | 30.10.2013 | CD Guadalajara | - | Sevilla Atlético | 1:0 | ||||
| 12. Jornada | 03.11.2013 | La Hoya Lorca CF | - | CD Guadalajara | 2:1 | ||||
| 13. Jornada | 09.11.2013 | CD Guadalajara | - | FC Cartagena | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 17.11.2013 | Albacete | - | CD Guadalajara | 3:3 | ||||
| 15. Jornada | 24.11.2013 | CD Guadalajara | - | La Roda CF | 3:1 | ||||
| 16. Jornada | 01.12.2013 | Arroyo CP | - | CD Guadalajara | 1:0 | ||||
| 18. Jornada | 15.12.2013 | CD Guadalajara | - | UD Melilla | 0:1 | ||||
| 19. Jornada | 21.12.2013 | San Fernando CD | - | CD Guadalajara | 2:1 |
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