| 9. Jornada | 25.10.2008 | 1. FC Nürnberg II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 2:2 | ||||
| 10. Jornada | 29.10.2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | SC Pfullendorf | 1:1 | ||||
| 11. Jornada | 01.11.2008 | SSV Ulm 1846 | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 2:2 | ||||
| 12. Jornada | 08.11.2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | Viktoria Aschaffenburg | 0:0 |  |
|||
| 13. Jornada | 15.11.2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | TSV 1860 München II | 1:2 | ||||
| 14. Jornada | 22.11.2008 | Hessen Kassel | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 3:1 | ||||
| 15. Jornada | 29.11.2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | SC Freiburg II | 2:0 | ||||
| 16. Jornada | 06.12.2008 | SpVgg Greuther Fürth II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 3:1 | ||||
| 22. Jornada | 13.03.2009 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | Darmstadt | 2:1 |
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