| 18. Jornada | 01.02.2004 | Jahn Regensburg | - | Erzgebirge Aue | 1:1 | ||||
| 20. Jornada | 15.02.2004 | Jahn Regensburg | - | MSV Duisburg | 0:5 | ||||
| 21. Jornada | 22.02.2004 | VfB Lübeck | - | Jahn Regensburg | 0:3 | ||||
| 22. Jornada | 29.02.2004 | Jahn Regensburg | - | SpVgg Unterhaching | 1:0 |  |
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| 23. Jornada | 07.03.2004 | Arminia Bielefeld | - | Jahn Regensburg | 0:0 |  |
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| 24. Jornada | 12.03.2004 | Eintracht Trier | - | Jahn Regensburg | 4:0 | ||||
| 25. Jornada | 21.03.2004 | Jahn Regensburg | - | 1. FC Union Berlin | 3:1 | |
|
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| 26. Jornada | 28.03.2004 | Alemannia Aachen | - | Jahn Regensburg | 1:0 | ||||
| 27. Jornada | 02.04.2004 | Jahn Regensburg | - | 1. FC Nürnberg | 2:1 | |
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| 28. Jornada | 11.04.2004 | VfL Osnabrück | - | Jahn Regensburg | 3:0 | ||||
| 29. Jornada | 16.04.2004 | Jahn Regensburg | - | Rot-Weiß Oberhausen | 1:1 | ||||
| 30. Jornada | 25.04.2004 | LR Ahlen | - | Jahn Regensburg | 3:1 | |
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| 31. Jornada | 02.05.2004 | Jahn Regensburg | - | Karlsruher SC | 1:1 | ||||
| 32. Jornada | 07.05.2004 | Wacker Burghausen | - | Jahn Regensburg | 2:0 | ||||
| 33. Jornada | 16.05.2004 | Jahn Regensburg | - | Mainz | 0:0 | ||||
| 34. Jornada | 23.05.2004 | Energie Cottbus | - | Jahn Regensburg | 3:0 |
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