| 18. Jornada | 11.03.2007 | Viktoria Plzeň | - | FK Mladá Boleslav | 0:0 | ||||
| 19. Jornada | 18.03.2007 | FK Mladá Boleslav | - | FK Jablonec 97 | 2:0 | ||||
| 20. Jornada | 02.04.2007 | Sparta Praga | - | FK Mladá Boleslav | 4:1 |  |
|||
| 21. Jornada | 08.04.2007 | FK Mladá Boleslav | - | FK Marila Příbram | 2:1 | ||||
| 22. Jornada | 14.04.2007 | SK Kladno | - | FK Mladá Boleslav | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 18.04.2007 | Tescoma Zlín | - | FK Mladá Boleslav | 0:2 | ||||
| 24. Jornada | 22.04.2007 | FK Mladá Boleslav | - | FK Teplice | 2:0 | ||||
| 25. Jornada | 29.04.2007 | Dynamo České Budějovice | - | FK Mladá Boleslav | 0:3 | ||||
| 26. Jornada | 06.05.2007 | FK Mladá Boleslav | - | 1. FC Brno | 2:0 | ||||
| 27. Jornada | 10.05.2007 | Slavia Praga | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 | |
|||
| 28. Jornada | 13.05.2007 | FK Mladá Boleslav | - | Baník Ostrava | 2:0 | ||||
| 29. Jornada | 21.05.2007 | FK SIAD Most | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 | |
|||
| 30. Jornada | 28.05.2007 | FK Mladá Boleslav | - | Slovan Liberec | 4:0 |  |
República Checa