| 20. Jornada | 02.03.2013 | Spartak Trnava | - | FC Nitra | 2:0 | ||||
| 30. Jornada | 23.04.2013 | MŠK Žilina | - | FC Nitra | 1:2 | ||||
| 28. Jornada | 27.04.2013 | 1. FC Tatran Prešov | - | FC Nitra | 0:1 | ||||
| 29. Jornada | 14.05.2013 | FC Nitra | - | MFK Košice | 1:0 | ||||
| 31. Jornada | 18.05.2013 | FC Nitra | - | Spartak Trnava | 3:3 |  |
|||
| 32. Jornada | 22.05.2013 | Slovan Bratislava | - | FC Nitra | 4:0 | ||||
| 33. Jornada | 26.05.2013 | FC Nitra | - | FK Senica | 0:1 |
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