| 10. Jornada | 02.10.2016 | Servette FC | - | FC Aarau | 1:0 |  |
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| 11. Jornada | 16.10.2016 | FC Aarau | - | FC Wil 1900 | 0:1 | ||||
| 12. Jornada | 22.10.2016 | FC Chiasso | - | FC Aarau | 3:1 | ||||
| 13. Jornada | 30.10.2016 | FC Aarau | - | FC Winterthur | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 26.11.2016 | FC Aarau | - | Neuchâtel Xamax FCS | 2:3 | ||||
| 17. Jornada | 04.12.2016 | FC Aarau | - | FC Wohlen | 1:0 | ||||
| 18. Jornada | 11.12.2016 | FC Le Mont | - | FC Aarau | 0:0 |
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