| 6. Jornada | 25.04.2009 | Zenit | - | FK Khimki | 4:2 |  |
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| 7. Jornada | 03.05.2009 | FK Khimki | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 2:2 | ||||
| 8. Jornada | 11.05.2009 | Spartak Nalchik | - | FK Khimki | 0:0 | ||||
| 9. Jornada | 16.05.2009 | FK Khimki | - | FK Moskva | 1:1 | ||||
| 10. Jornada | 23.05.2009 | Terek Grozny | - | FK Khimki | 2:0 | ||||
| 12. Jornada | 13.06.2009 | Spartak Moskva | - | FK Khimki | 1:0 | ||||
| 11. Jornada | 06.07.2009 | FK Khimki | - | Rubin Kazan | 2:3 | ||||
| 13. Jornada | 10.07.2009 | FK Khimki | - | FK Saturn | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 19.07.2009 | FK Tom Tomsk | - | FK Khimki | 4:0 | |
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| 17. Jornada | 09.08.2009 | FK Rostov | - | FK Khimki | 2:0 |
Rusia