| 1. Jornada | 30.07.2016 | Zenit | - | Lokomotiv Moskva | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 06.08.2016 | FK Ufa | - | Zenit | 0:0 | ||||
| 3. Jornada | 12.08.2016 | Zenit | - | FK Rostov | 3:2 | ||||
| 4. Jornada | 20.08.2016 | Zenit | - | CSKA Moscú | 1:1 |  |
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| 5. Jornada | 27.08.2016 | Zenit | - | FK Amkar Perm | 3:0 | ||||
| 6. Jornada | 11.09.2016 | Arsenal Tula | - | Zenit | 0:5 | ||||
| 8. Jornada | 25.09.2016 | Anzhi Makhachkala | - | Zenit | 2:2 | ||||
| 10. Jornada | 16.10.2016 | FK Ural | - | Zenit | 0:2 |  |
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| 12. Jornada | 30.10.2016 | Zenit | - | FK Tom Tomsk | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 20.11.2016 | Zenit | - | Krylia Sovetov | 3:1 | ||||
| 18. Jornada | 04.03.2017 | CSKA Moscú | - | Zenit | 0:0 | ||||
| 19. Jornada | 12.03.2017 | FK Amkar Perm | - | Zenit | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 02.04.2017 | Rubin Kazan | - | Zenit | 0:2 | ||||
| 23. Jornada | 16.04.2017 | Spartak Moskva | - | Zenit | 2:1 | ||||
| 24. Jornada | 22.04.2017 | Zenit | - | FK Ural | 2:0 | ||||
| 25. Jornada | 26.04.2017 | FK Orenburg | - | Zenit | 0:1 | |
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| 26. Jornada | 01.05.2017 | FK Tom Tomsk | - | Zenit | 0:2 | |
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| 27. Jornada | 07.05.2017 | Zenit | - | Terek Grozny | 0:1 |  |
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