| Grupo A | 11.09.2016 | FBC Melgar | - | Deportivo Municipal | 2:1 | ||||
| Grupo A | 19.09.2016 | Real Garcilaso | - | FBC Melgar | 1:2 | ||||
| Grupo A | 25.09.2016 | FBC Melgar | - | Defensor La Bocana | 1:0 | ||||
| Grupo A | 28.09.2016 | Juan Aurich | - | FBC Melgar | 1:1 | ||||
| Grupo A | 24.10.2016 | FBC Melgar | - | Unión Comercio | 1:0 | ||||
| Grupo A | 02.11.2016 | FBC Melgar | - | Real Garcilaso | 0:0 | ||||
| Grupo A | 18.11.2016 | Defensor La Bocana | - | FBC Melgar | 1:3 |  |
|||
| Grupo A | 22.11.2016 | FBC Melgar | - | Juan Aurich | 1:2 |
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