| 1. Jornada | 05.02.2016 | Universidad Técnica | - | FBC Melgar | 1:3 | ||||
| 3. Jornada | 13.02.2016 | Ayacucho FC | - | FBC Melgar | 0:3 |  |
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| 4. Jornada | 21.02.2016 | FBC Melgar | - | Juan Aurich | 2:3 | ||||
| 6. Jornada | 27.02.2016 | FBC Melgar | - | Defensor La Bocana | 2:2 | ||||
| 8. Jornada | 09.03.2016 | Universidad San Martín | - | FBC Melgar | 2:1 | |
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| 9. Jornada | 12.03.2016 | FBC Melgar | - | Deportivo Municipal | 1:1 | |
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| 10. Jornada | 01.04.2016 | Comerciantes Unidos | - | FBC Melgar | 2:0 | |
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| 12. Jornada | 23.04.2016 | Alianza Atlético | - | FBC Melgar | 1:0 | ||||
| 13. Jornada | 27.04.2016 | FBC Melgar | - | Alianza Lima | 1:0 |
Perú