| 1. Jornada | 30.10.2016 | Panegialios FC | - | AO Chania | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 06.11.2016 | AO Chania | - | Agrotikos Asteras | 0:2 | ||||
| 3. Jornada | 27.11.2016 | Panserraikos | - | AO Chania | 1:2 | ||||
| 4. Jornada | 04.12.2016 | AO Chania | - | Acharnaikos FC | 2:3 |  |
|||
| 5. Jornada | 11.12.2016 | OFI Heraklion | - | AO Chania | 3:0 | ||||
| 6. Jornada | 19.12.2016 | AO Chania | - | Lamia | 0:3 | ||||
| 7. Jornada | 22.12.2016 | Aris Saloniki | - | AO Chania | 2:1 | ||||
| 8. Jornada | 04.01.2017 | Panthrakikos | - | AO Chania | 0:2 | ||||
| 15. Jornada | 11.02.2017 | AO Chania | - | AO Trikala | 1:0 | ||||
| 17. Jornada | 22.02.2017 | GS Kallithea | - | AO Chania | 3:1 |  |
|||
| 18. Jornada | 26.02.2017 | AO Chania | - | Panegialios FC | 1:0 | ||||
| 19. Jornada | 05.03.2017 | Agrotikos Asteras | - | AO Chania | 2:0 |
Grecia