| 17. Jornada | 01.03.2009 | FC Concordia Basel | - | FC Biel/Bienne | 1:1 | ||||
| 18. Jornada | 08.03.2009 | FC Locarno | - | FC Concordia Basel | 3:1 | ||||
| 20. Jornada | 23.03.2009 | FC Thun | - | FC Concordia Basel | 1:0 | ||||
| 16. Jornada | 27.03.2009 | Yverdon Sport FC | - | FC Concordia Basel | 1:1 | ||||
| 21. Jornada | 03.04.2009 | FC Concordia Basel | - | FC Gossau | 2:1 | ||||
| 22. Jornada | 11.04.2009 | FC Concordia Basel | - | FC Stade Nyonnais | 2:1 | ||||
| 23. Jornada | 20.04.2009 | FC Wohlen | - | FC Concordia Basel | 2:1 | ||||
| 24. Jornada | 23.04.2009 | FC La Chaux-de-Fonds | - | FC Concordia Basel | 2:1 | ||||
| 25. Jornada | 26.04.2009 | FC Concordia Basel | - | FC Wil 1900 | 3:4 |  |
|||
| 26. Jornada | 02.05.2009 | FC Lausanne-Sport | - | FC Concordia Basel | 2:3 | |
|||
| 27. Jornada | 11.05.2009 | FC Concordia Basel | - | FC Lugano | 2:3 | ||||
| 28. Jornada | 18.05.2009 | FC Concordia Basel | - | FC St. Gallen | 0:1 | ||||
| 29. Jornada | 23.05.2009 | FC Winterthur | - | FC Concordia Basel | 4:5 | |
|||
| 30. Jornada | 28.05.2009 | FC Concordia Basel | - | FC Schaffhausen | 3:0 | |
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