| 5. Jornada | 20.09.2008 | Bayern Múnich | - | Werder Bremen | 2:5 | ||||
| 17. Jornada | 13.12.2008 | Werder Bremen | - | Wolfsburgo | 2:1 | ||||
| 18. Jornada | 01.02.2009 | Werder Bremen | - | Arminia Bielefeld | 1:2 | ||||
| 19. Jornada | 07.02.2009 | Schalke | - | Werder Bremen | 1:0 | ||||
| 23. Jornada | 07.03.2009 | Hoffenheim | - | Werder Bremen | 0:0 | ||||
| 24. Jornada | 15.03.2009 | Werder Bremen | - | Stuttgart | 4:0 | ||||
| 25. Jornada | 21.03.2009 | Borussia Dortmund | - | Werder Bremen | 1:0 | ||||
| 26. Jornada | 05.04.2009 | Werder Bremen | - | Hannover | 4:1 | ||||
| 28. Jornada | 19.04.2009 | Hertha | - | Werder Bremen | 2:1 | ||||
| 29. Jornada | 25.04.2009 | Werder Bremen | - | VfL Bochum | 3:2 | ||||
| 30. Jornada | 03.05.2009 | Colonia | - | Werder Bremen | 1:0 | ||||
| 31. Jornada | 10.05.2009 | Werder Bremen | - | Hamburgo | 2:0 |  |
|||
| 32. Jornada | 13.05.2009 | Eintracht Frankfurt | - | Werder Bremen | 0:5 | ||||
| 33. Jornada | 16.05.2009 | Werder Bremen | - | Karlsruher SC | 1:3 | |
|||
| 34. Jornada | 23.05.2009 | Wolfsburgo | - | Werder Bremen | 5:1 |
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