| 15. Jornada | 08.01.2006 | Levadiakos | - | OFI Heraklion | 1:0 | ||||
| 16. Jornada | 15.01.2006 | OFI Heraklion | - | Apollon Kalamarias | 1:2 |  |
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| 17. Jornada | 29.01.2006 | Skoda Xanthi | - | OFI Heraklion | 0:0 | ||||
| 18. Jornada | 05.02.2006 | OFI Heraklion | - | Atromitos | 0:0 | ||||
| 19. Jornada | 11.02.2006 | Iraklis Saloniki | - | OFI Heraklion | 2:0 | ||||
| 20. Jornada | 18.02.2006 | OFI Heraklion | - | AO Egaleo | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 26.02.2006 | AE Lárissa | - | OFI Heraklion | 1:0 | ||||
| 22. Jornada | 05.03.2006 | Olympiacos | - | OFI Heraklion | 4:0 | ||||
| 23. Jornada | 12.03.2006 | OFI Heraklion | - | Ionikos Nikea | 3:0 | ||||
| 24. Jornada | 19.03.2006 | Panathinaikos | - | OFI Heraklion | 3:1 |  |
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| 25. Jornada | 26.03.2006 | OFI Heraklion | - | Panionios GSS | 1:1 | ||||
| 26. Jornada | 02.04.2006 | GS Kallithea | - | OFI Heraklion | 0:1 | ||||
| 27. Jornada | 09.04.2006 | OFI Heraklion | - | Akratitos Liosion | 2:2 | ||||
| 28. Jornada | 16.04.2006 | AEK Athen | - | OFI Heraklion | 2:0 | ||||
| 29. Jornada | 30.04.2006 | OFI Heraklion | - | PAOK Saloniki | 2:1 | ||||
| 30. Jornada | 14.05.2006 | OFI Heraklion | - | Levadiakos | 2:0 |
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