| 17. Jornada | 03.03.2025 | FC Zlín | - | 1. SK Prostějov | 3:0 | ||||
| 18. Jornada | 07.03.2025 | 1. SK Prostějov | - | Viktoria Žižkov | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 14.03.2025 | FC Sellier & Bellot Vlašim | - | 1. SK Prostějov | 3:1 | ||||
| 20. Jornada | 28.03.2025 | 1. SK Prostějov | - | Baník Ostrava B | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 04.04.2025 | Vysočina Jihlava | - | 1. SK Prostějov | 3:0 | ||||
| 22. Jornada | 11.04.2025 | 1. SK Prostějov | - | Slavia Praha B | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 16.04.2025 | Zbrojovka Brno | - | 1. SK Prostějov | 1:1 | ||||
| 24. Jornada | 20.04.2025 | 1. SK Prostějov | - | SFC Opava | 0:0 | ||||
| 25. Jornada | 27.04.2025 | FK Varnsdorf | - | 1. SK Prostějov | 1:0 |
República Checa