| 3. Jornada | 16.08.2008 | Tescoma Zlín | - | Viktoria Žižkov | 1:0 | ||||
| 4. Jornada | 24.08.2008 | SK Kladno | - | Tescoma Zlín | 1:1 | ||||
| 8. Jornada | 28.09.2008 | FK Teplice | - | Tescoma Zlín | 2:0 | ||||
| 10. Jornada | 19.10.2008 | 1. FK Příbram | - | Tescoma Zlín | 3:0 | ||||
| 12. Jornada | 02.11.2008 | Bohemians Praha | - | Tescoma Zlín | 1:0 | ||||
| 13. Jornada | 08.11.2008 | Sparta Praga | - | Tescoma Zlín | 2:0 | ||||
| 17. Jornada | 22.02.2009 | Viktoria Žižkov | - | Tescoma Zlín | 1:1 | ||||
| 18. Jornada | 28.02.2009 | Tescoma Zlín | - | SK Kladno | 0:0 | ||||
| 19. Jornada | 08.03.2009 | Dynamo České Budějovice | - | Tescoma Zlín | 1:0 | ||||
| 20. Jornada | 14.03.2009 | Tescoma Zlín | - | Slovan Liberec | 3:3 | ||||
| 21. Jornada | 22.03.2009 | Slavia Praga | - | Tescoma Zlín | 1:0 | ||||
| 22. Jornada | 04.04.2009 | Tescoma Zlín | - | FK Teplice | 1:1 | ||||
| 23. Jornada | 12.04.2009 | Viktoria Plzeň | - | Tescoma Zlín | 5:0 | ||||
| 25. Jornada | 26.04.2009 | Baník Ostrava | - | Tescoma Zlín | 1:3 | ||||
| 26. Jornada | 02.05.2009 | Tescoma Zlín | - | Bohemians Praha | 2:0 | ||||
| 27. Jornada | 10.05.2009 | Tescoma Zlín | - | Sparta Praga | 2:1 | ||||
| 28. Jornada | 17.05.2009 | Sigma Olomouc | - | Tescoma Zlín | 1:1 |
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